I rapporti sono difficili. I vescovi non gradiscono dialogare con NSC, di cui spesso non conoscono le vere posizioni. Però, nell’ottobre del 2007, per la prima volta, il Presidente della CEI Card. Angelo Bagnasco ha ricevuto il portavoce di NSC che gli ha esposto le posizioni e le iniziative del movimento. Gli   ha inoltre  precisato che NSC non chiede nessun riconoscimento alla gerarchia e  gli ha fatto presente che gli aderenti ed i simpatizzanti di NSC sono ben presenti nelle strutture della Chiesa ed hanno rapporti di collaborazione con la vasta area dei cattolici che si ispirano al Concilio. Con la nuova Presidenza della CEI del Card. Zuppi i rapporti sono destinati a migliorare ed è ipotizzabile un incontro. Particolarmente critica è stata la posizione di NSC nei confronti della linea della CEI sulla pedofilia del clero.